Michael (Shane West) porzuca swoją rolę jako agent w terenie i wznawia swoją rolę wewnątrz Wydziału prowadząc Operacje. Po otrzymaniu kluczowej informacji od Birkhoffa (Aaron Stanford), Nikita (Maggie Q) przygotowuje się do tajnej misji, która zabiera ją na niebezpieczny teren. Kiedy Michael, Alex (Lyndsy Fonseca) i Ryan (Noah Bean) dowiadują się, podążają za nią do Kosowa, ale rezultat ma daleko idące konsekwencje dla Wydziału.