Callen i Sam są uwięzieni w uzbrojonym okręcie podwodnym, który terroryści chcą wykorzystać, aby trafić w lotniskowiec w San Diego. Tymczasem Hetty omija rozkazy i rezygnuje ze swojej podróży do Waszyngtonu, jak zespół stara się zlokalizować i ocalić Callena i Sama oraz powstrzymać atak terrorystyczny.