Drugi sezon chwalonego przez krytyków dramatu, w którym występują Carrie-Anne Moss i Katherine Parkinson rozpoczyna się kilka miesięcy po wydarzeniach pierwszego sezonu. Niska (Emily Berrington) żyje jako zbieg w Berlinie, gdzie nieoczekiwane romantyczne spotkanie prowadzi ją do wielkiej decyzji z daleko idącymi konsekwencjami. W Wielkiej Brytanii, Leo (Colin Morgan), Max (Ivanno Jeremiah) i Mia (Gemma Chan) zaszyli się w nadmorskiej kryjówce i pozostają w kontakcie z światem ludzi. Ale ich sekret jest w niebezpieczeństwie jak Mia rozwija uczucia do swojego ludzkiego szefa, Eda (Sam Palladio). Leo i Max przychodzą z pomocą Hester (Sonya Cassidy), bardzo specjalnemu Synthowi, ale jak tajemnicza organizacja zaczyna ich ścigać, tutaj są tragiczne konsekwencje. Rodzina Hawkinsów zmaga się z tym, aby zostawić przeszłe wydarzenia za sobą jak osiedlają się w nowym domu. Laura (Katherine Parkinson) i Joe (Tom Goodman-Hill) pracują ciężko, aby naprawić swoją zniszczoną relację poprzez terapię. Sprawy wydają się polepszyć, ale jak Joe zostaje zwolniony i zastąpiony przez Syntha w pracy, nowe napięcie pojawia się między nimi. Sprawy się komplikują jak gość pojawia się niezapowiedziany u ich drzwi. W San Francisco, Athena Morrow (Carrie-Anne Moss), zaciekły naukowiec badający sztuczną inteligencję zostaje zwerbowany przez charyzmatycznego Milo Khoury’ego (Marshall Allman), przedsiębiorczą siłę stojącą za spółką technologiczną Qualię, do tajnego projektu, aby stworzyć świadomych Synthów na masowy rynek.