Drugi sezon rozpoczyna się trzy miesiące po szokującym aresztowaniu głowy Empire Entertainment Lucious Lyon (Terrence Howard). Nadal w areszcie federalnym, Lucious próbuje prowadzić Empire od środka, kiedy znany prokurator stanowi stawia swoje polityczne ambicje na szali, aby go dopaść — bez względu na to co będzie trzeba zrobić. Tymczasem Cookie organizuje pełen gwiazd koncert #FreeLucious dla jego wsparcia, kiedy planuje z Andre, Hakeemem, Aniką i znającą biznes Mimi Whiteman (gościnnie Marisa Tomei) jak sfinalizować przejęcie Empire.