Szlak tajemniczej organizacji zwanej "Armia 12 małp" prowadzi Cole'a do szpitala psychiatrycznego w 2015 roku, gdzie pacjent posiada klucz do plagi, która zniszczy świat. Tymczasem pomimo ostrzeżeń, że jej zaangażowanie może zakłócić bieg historii, dr Railly ryzykuje woje życie, aby mu pomóc.