Uwięziony poza ogrodzeniem pod koniec pierwszego odcinka, Xander powraca do Wayward Pines - przyprowadzając kogoś nieoczekiwanego ze sobą kto może pomóc dowiedzieć się więcej o intencjach Abbie. Tymczasem Rebecca umieszcza sama siebie w sprzeczności z Megan w celu pomocy Lucy, młodej dziewczynie, która próbuje uciec przed tradycją Wayward Pines, a CJ przewodzi dzielnej grupie w wyprawie poza ogrodzenie, aby rozszerzyć władanie ludzkości na Ziemi, pomimo protestów Theo.