Brennan i zespół Jeffersonian rozpaczliwie pracują, aby wydostać Bootha z więzienia, oczyścić jego nazwisko i uwolnić go od zbrodni, których nie popełnił. Szczątki mężczyzny, który był martwy od szesnastu lat mogą być punktem początkowym w całej rządowej konspiracji, która ostatecznie umieściła Bootha w więzieniu. Tymczasem Booth stawia czoła wyzwaniu ze strony nowego i politycznie ambitnego agenta FBBI (gościnnie John Boyd). Jak czeka na swój proces, Bootha również zdaje sobie sprawę, że wielu więźniów, z którymi jest zamknięty to kryminaliści, których tutaj umieścił, a Daisy i Sweets mają niespodziankę dla reszty zespołu Jeffersonian.