W następstwie jego wycieczki do Maveth, Coulson jest bardziej zdeterminowany niż kiedykolwiek, aby dopaść Gideona Malicka i położyć kres Hydrze raz na zawsze. Tymczasem Daisy i zespół spotykają kolejnych Inhumanów, którzy mają moce jakich nie widzieli nigdy wcześniej, ale czy okażą się być przyjaciółmi czy wrogami S.H.I.E.L.D.?

Nie będąc dalej w stanie utrzymać ludzi z mocami przed uwagą opinii publicznej, Daisy i Mack naciskają w kierunku znalezienia kolejnych Inhumanów, budując zespół tajnych wojowników, których misją jest szkolenie i chronienie ludzi z mocami. Jednak coraz większa obecność Inhumanów okazuje się być polaryzującym problemem, a zespół S.H.I.E.L.D. musi stawić czoła skonfliktowanej opinii publicznej i bronić swojego zespołu przed grupami, które mają bardziej ekstremalną ideologię.

Podział pomiędzy tymi, którzy chcą chronić Inhumanów a tymi, którzy szukają sposobu na ich zniszczenie, jest coraz bardziej szeroki, a Hydra, teraz wzmocniona przez Granta Warda, pojawia się ponownie. Jednak Ward nie jest już dłużej tym samym złowieszczym zdrajcą, którego kiedyś znali, a zespół stawia czoła zupełnie nowemu wrogowi, którego motywy, cele i siły nie są jasne. Niepewni co do tego komu (albo czemu) stawiają czoła, stawki dla S.H.I.E.L.D. i ich grupy Sekretnych Wojowników są wyższe niż kiedykolwiek, co zbliża pewnych członków zespołu bardziej i dzieli innych. Czy S.H.I.E.L.D. będzie w stanie powstrzymać najbardziej potężnych Inhumanów przed kroczeniem po Ziemi?